Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB23Q9ULC3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB23Q9ULC3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms