Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF3C4Q9UKN8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C4Q9UKN8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms