Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABGEF1Q9UJ41 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
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