Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCN11AQ9UI33 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms