Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TVP23BQ9NYZ1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms