Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BATF3Q9NR55 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BATF3Q9NR55 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms