Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLCO1B3Q9NPD5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1B3Q9NPD5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms