Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MXRA8Q9BRK3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MXRA8Q9BRK3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MXRA8Q9BRK3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms