Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLF1Q9BQI6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms