Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNGAP1Q96PV0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNGAP1Q96PV0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms