Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGD4Q96M96 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGD4Q96M96 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGD4Q96M96 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms