Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC45A3Q96JT2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC45A3Q96JT2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC45A3Q96JT2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms