Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC16BQ96JE7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC16BQ96JE7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms