Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NXNL1Q96CM4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms