Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUBCNQ92622 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RUBCNQ92622 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUBCNQ92622 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms