Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC38.76■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
TOPBP1Q92547 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC38.7■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
TOPBP1Q92547 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC38.64■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
TOPBP1Q92547 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TOPBP1Q92547 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms