Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN12Q8IYM2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN12Q8IYM2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN12Q8IYM2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN12Q8IYM2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN12Q8IYM2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN12Q8IYM2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN12Q8IYM2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN12Q8IYM2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN12Q8IYM2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN12Q8IYM2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN12Q8IYM2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN12Q8IYM2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN12Q8IYM2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SLFN12Q8IYM2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLFN12Q8IYM2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms