Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2M8

PNCK, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCKQ6P2M8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNCKQ6P2M8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PNCKQ6P2M8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNCKQ6P2M8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms