Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV1

RPL13AP3, Putative 60S ribosomal protein L13a protein RPL13AP3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP3Q6NVV1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL13AP3Q6NVV1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL13AP3Q6NVV1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms