Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf135Q5VTT2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms