Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6L9

ERMARD, Endoplasmic reticulum membrane-associated RNA degradation protein, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERMARDQ5T6L9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERMARDQ5T6L9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERMARDQ5T6L9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERMARDQ5T6L9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERMARDQ5T6L9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERMARDQ5T6L9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERMARDQ5T6L9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERMARDQ5T6L9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERMARDQ5T6L9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERMARDQ5T6L9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERMARDQ5T6L9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERMARDQ5T6L9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERMARDQ5T6L9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERMARDQ5T6L9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERMARDQ5T6L9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERMARDQ5T6L9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERMARDQ5T6L9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERMARDQ5T6L9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERMARDQ5T6L9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERMARDQ5T6L9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERMARDQ5T6L9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERMARDQ5T6L9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms