Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFTN1Q14699 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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