Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HNF4GQ14541 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HNF4GQ14541 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HNF4GQ14541 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HNF4GQ14541 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HNF4GQ14541 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HNF4GQ14541 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.5 ms