Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH18Q13634 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH18Q13634 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
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