Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIGQ13278 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIGQ13278 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIGQ13278 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIGQ13278 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIGQ13278 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIGQ13278 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RIGQ13278 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIGQ13278 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIGQ13278 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIGQ13278 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIGQ13278 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIGQ13278 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIGQ13278 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIGQ13278 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RIGQ13278 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RIGQ13278 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RIGQ13278 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIGQ13278 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIGQ13278 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIGQ13278 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIGQ13278 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIGQ13278 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIGQ13278 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIGQ13278 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIGQ13278 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIGQ13278 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIGQ13278 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIGQ13278 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIGQ13278 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIGQ13278 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RIGQ13278 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIGQ13278 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIGQ13278 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIGQ13278 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIGQ13278 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIGQ13278 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIGQ13278 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIGQ13278 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIGQ13278 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIGQ13278 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RIGQ13278 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIGQ13278 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIGQ13278 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIGQ13278 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIGQ13278 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIGQ13278 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIGQ13278 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIGQ13278 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RIGQ13278 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIGQ13278 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIGQ13278 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIGQ13278 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIGQ13278 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIGQ13278 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIGQ13278 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIGQ13278 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIGQ13278 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RIGQ13278 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIGQ13278 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIGQ13278 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIGQ13278 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIGQ13278 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIGQ13278 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIGQ13278 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIGQ13278 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIGQ13278 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIGQ13278 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIGQ13278 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIGQ13278 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIGQ13278 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIGQ13278 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIGQ13278 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RIGQ13278 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIGQ13278 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIGQ13278 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIGQ13278 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIGQ13278 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIGQ13278 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIGQ13278 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIGQ13278 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIGQ13278 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIGQ13278 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIGQ13278 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIGQ13278 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RIGQ13278 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIGQ13278 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIGQ13278 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIGQ13278 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIGQ13278 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIGQ13278 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RIGQ13278 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIGQ13278 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIGQ13278 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIGQ13278 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIGQ13278 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIGQ13278 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIGQ13278 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIGQ13278 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIGQ13278 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms