Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PLOD1Q02809 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLOD1Q02809 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms