Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP3Q02447 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP3Q02447 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP3Q02447 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP3Q02447 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP3Q02447 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SP3Q02447 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP3Q02447 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP3Q02447 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP3Q02447 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SP3Q02447 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SP3Q02447 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SP3Q02447 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SP3Q02447 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SP3Q02447 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SP3Q02447 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SP3Q02447 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SP3Q02447 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SP3Q02447 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SP3Q02447 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SP3Q02447 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SP3Q02447 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SP3Q02447 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SP3Q02447 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SP3Q02447 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SP3Q02447 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SP3Q02447 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SP3Q02447 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SP3Q02447 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SP3Q02447 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SP3Q02447 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SP3Q02447 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SP3Q02447 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SP3Q02447 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SP3Q02447 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SP3Q02447 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SP3Q02447 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SP3Q02447 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SP3Q02447 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SP3Q02447 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SP3Q02447 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP3Q02447 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP3Q02447 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP3Q02447 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP3Q02447 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP3Q02447 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP3Q02447 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SP3Q02447 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SP3Q02447 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SP3Q02447 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SP3Q02447 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SP3Q02447 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SP3Q02447 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SP3Q02447 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SP3Q02447 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SP3Q02447 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SP3Q02447 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SP3Q02447 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SP3Q02447 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SP3Q02447 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SP3Q02447 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SP3Q02447 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SP3Q02447 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SP3Q02447 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SP3Q02447 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SP3Q02447 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SP3Q02447 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SP3Q02447 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SP3Q02447 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SP3Q02447 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SP3Q02447 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SP3Q02447 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SP3Q02447 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SP3Q02447 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SP3Q02447 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SP3Q02447 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SP3Q02447 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SP3Q02447 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SP3Q02447 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SP3Q02447 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SP3Q02447 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SP3Q02447 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SP3Q02447 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SP3Q02447 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SP3Q02447 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SP3Q02447 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SP3Q02447 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SP3Q02447 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SP3Q02447 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SP3Q02447 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SP3Q02447 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SP3Q02447 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SP3Q02447 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SP3Q02447 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SP3Q02447 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SP3Q02447 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SP3Q02447 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SP3Q02447 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SP3Q02447 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SP3Q02447 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms