Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE1BQ01064 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDE1BQ01064 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE1BQ01064 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms