Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EFNB1P98172 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms