Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEC24CP53992 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC24CP53992 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC24CP53992 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms