Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMD8P48556 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMD8P48556 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms