Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDKN2BP42772 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKN2BP42772 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms