Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN7P35236 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN7P35236 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 270.7 ms