Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCC1P33527 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
ABCC1P33527 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ABCC1P33527 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ABCC1P33527 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms