Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PNMA6AP0CW24 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PNMA6AP0CW24 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA6AP0CW24 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms