Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM3P06753 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM3P06753 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM3P06753 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM3P06753 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM3P06753 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM3P06753 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM3P06753 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM3P06753 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM3P06753 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM3P06753 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM3P06753 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM3P06753 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM3P06753 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM3P06753 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM3P06753 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM3P06753 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM3P06753 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM3P06753 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM3P06753 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM3P06753 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM3P06753 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM3P06753 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM3P06753 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM3P06753 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM3P06753 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPM3P06753 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPM3P06753 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPM3P06753 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TPM3P06753 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TPM3P06753 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM3P06753 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM3P06753 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM3P06753 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM3P06753 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM3P06753 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM3P06753 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM3P06753 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM3P06753 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM3P06753 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM3P06753 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM3P06753 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM3P06753 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM3P06753 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM3P06753 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM3P06753 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM3P06753 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM3P06753 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM3P06753 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM3P06753 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM3P06753 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM3P06753 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM3P06753 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM3P06753 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM3P06753 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM3P06753 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM3P06753 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM3P06753 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM3P06753 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM3P06753 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM3P06753 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM3P06753 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM3P06753 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM3P06753 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM3P06753 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM3P06753 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM3P06753 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM3P06753 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM3P06753 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM3P06753 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM3P06753 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM3P06753 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM3P06753 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM3P06753 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM3P06753 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM3P06753 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM3P06753 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM3P06753 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM3P06753 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM3P06753 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM3P06753 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM3P06753 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM3P06753 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM3P06753 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM3P06753 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM3P06753 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM3P06753 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM3P06753 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM3P06753 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM3P06753 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM3P06753 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM3P06753 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM3P06753 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM3P06753 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM3P06753 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM3P06753 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM3P06753 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM3P06753 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM3P06753 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM3P06753 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms