Protein–RNA interactions for Protein: P05771

PRKCB, Protein kinase C beta type, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCBP05771 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCBP05771 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCBP05771 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCBP05771 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms