Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1P04632 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1P04632 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1P04632 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms