Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2P04141 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2P04141 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2P04141 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2P04141 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSF2P04141 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2P04141 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2P04141 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2P04141 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2P04141 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2P04141 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2P04141 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2P04141 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2P04141 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2P04141 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2P04141 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2P04141 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2P04141 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2P04141 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2P04141 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2P04141 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2P04141 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSF2P04141 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2P04141 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2P04141 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2P04141 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2P04141 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2P04141 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2P04141 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2P04141 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2P04141 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2P04141 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF2P04141 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF2P04141 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF2P04141 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF2P04141 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF2P04141 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF2P04141 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSF2P04141 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSF2P04141 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF2P04141 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF2P04141 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF2P04141 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF2P04141 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF2P04141 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF2P04141 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF2P04141 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF2P04141 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2P04141 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2P04141 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2P04141 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2P04141 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2P04141 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2P04141 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2P04141 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2P04141 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2P04141 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2P04141 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2P04141 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2P04141 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2P04141 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2P04141 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF2P04141 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2P04141 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2P04141 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2P04141 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2P04141 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2P04141 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2P04141 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2P04141 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2P04141 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2P04141 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2P04141 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF2P04141 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF2P04141 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF2P04141 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF2P04141 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF2P04141 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2P04141 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2P04141 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2P04141 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2P04141 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2P04141 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2P04141 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2P04141 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2P04141 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2P04141 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2P04141 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2P04141 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2P04141 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF2P04141 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF2P04141 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF2P04141 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF2P04141 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF2P04141 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF2P04141 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF2P04141 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF2P04141 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF2P04141 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF2P04141 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms