Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOP3BO95985 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms