Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP3O75386 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP3O75386 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP3O75386 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP3O75386 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP3O75386 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP3O75386 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP3O75386 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP3O75386 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP3O75386 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP3O75386 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP3O75386 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP3O75386 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP3O75386 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP3O75386 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP3O75386 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP3O75386 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TULP3O75386 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP3O75386 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP3O75386 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP3O75386 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP3O75386 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP3O75386 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TULP3O75386 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP3O75386 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP3O75386 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP3O75386 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP3O75386 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP3O75386 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP3O75386 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP3O75386 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP3O75386 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP3O75386 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP3O75386 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP3O75386 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP3O75386 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP3O75386 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP3O75386 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP3O75386 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP3O75386 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TULP3O75386 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP3O75386 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP3O75386 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP3O75386 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP3O75386 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP3O75386 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP3O75386 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP3O75386 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP3O75386 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP3O75386 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP3O75386 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP3O75386 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TULP3O75386 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP3O75386 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP3O75386 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP3O75386 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP3O75386 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP3O75386 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP3O75386 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP3O75386 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP3O75386 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP3O75386 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP3O75386 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TULP3O75386 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP3O75386 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP3O75386 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP3O75386 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP3O75386 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP3O75386 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP3O75386 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP3O75386 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP3O75386 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP3O75386 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP3O75386 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP3O75386 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP3O75386 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP3O75386 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP3O75386 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP3O75386 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TULP3O75386 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP3O75386 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP3O75386 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP3O75386 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP3O75386 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP3O75386 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP3O75386 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP3O75386 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP3O75386 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP3O75386 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TULP3O75386 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP3O75386 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP3O75386 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP3O75386 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP3O75386 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP3O75386 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP3O75386 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TULP3O75386 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP3O75386 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP3O75386 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TULP3O75386 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms