Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAD1O00515 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAD1O00515 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LAD1O00515 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAD1O00515 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAD1O00515 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAD1O00515 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAD1O00515 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAD1O00515 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAD1O00515 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LAD1O00515 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAD1O00515 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAD1O00515 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAD1O00515 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAD1O00515 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LAD1O00515 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAD1O00515 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAD1O00515 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAD1O00515 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAD1O00515 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAD1O00515 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAD1O00515 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAD1O00515 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAD1O00515 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAD1O00515 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAD1O00515 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAD1O00515 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAD1O00515 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAD1O00515 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAD1O00515 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAD1O00515 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAD1O00515 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAD1O00515 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAD1O00515 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LAD1O00515 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAD1O00515 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAD1O00515 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAD1O00515 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAD1O00515 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAD1O00515 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAD1O00515 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAD1O00515 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAD1O00515 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LAD1O00515 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAD1O00515 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAD1O00515 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAD1O00515 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAD1O00515 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAD1O00515 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAD1O00515 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAD1O00515 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAD1O00515 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAD1O00515 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAD1O00515 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAD1O00515 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAD1O00515 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAD1O00515 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAD1O00515 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAD1O00515 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAD1O00515 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAD1O00515 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAD1O00515 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAD1O00515 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAD1O00515 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAD1O00515 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LAD1O00515 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LAD1O00515 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAD1O00515 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAD1O00515 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAD1O00515 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAD1O00515 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAD1O00515 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAD1O00515 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAD1O00515 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAD1O00515 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAD1O00515 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAD1O00515 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAD1O00515 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAD1O00515 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAD1O00515 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAD1O00515 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAD1O00515 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAD1O00515 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LAD1O00515 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAD1O00515 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAD1O00515 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAD1O00515 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAD1O00515 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAD1O00515 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAD1O00515 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAD1O00515 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAD1O00515 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAD1O00515 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAD1O00515 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAD1O00515 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAD1O00515 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAD1O00515 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAD1O00515 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAD1O00515 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAD1O00515 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms