Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms