Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT87PA6NCN2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms