Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAXBP1Q9Y5B6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAXBP1Q9Y5B6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAXBP1Q9Y5B6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms