Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NOP58Q9Y2X3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NOP58Q9Y2X3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NOP58Q9Y2X3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms