Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HPSEQ9Y251 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPSEQ9Y251 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPSEQ9Y251 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms