Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN79

SOX13, Transcription factor SOX-13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX13Q9UN79 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX13Q9UN79 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX13Q9UN79 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX13Q9UN79 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX13Q9UN79 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX13Q9UN79 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX13Q9UN79 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX13Q9UN79 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms