Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S0

NANOG, Homeobox protein NANOG, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGQ9H9S0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NANOGQ9H9S0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NANOGQ9H9S0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms