Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UPF3BQ9BZI7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UPF3BQ9BZI7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UPF3BQ9BZI7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UPF3BQ9BZI7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UPF3BQ9BZI7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UPF3BQ9BZI7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UPF3BQ9BZI7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
UPF3BQ9BZI7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UPF3BQ9BZI7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
UPF3BQ9BZI7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UPF3BQ9BZI7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UPF3BQ9BZI7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UPF3BQ9BZI7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UPF3BQ9BZI7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UPF3BQ9BZI7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UPF3BQ9BZI7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UPF3BQ9BZI7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UPF3BQ9BZI7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
UPF3BQ9BZI7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UPF3BQ9BZI7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UPF3BQ9BZI7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UPF3BQ9BZI7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
UPF3BQ9BZI7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UPF3BQ9BZI7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms